A UFPEDA é uma Coleção especializada em bactérias, predominantemente actinobactérias e outras eubactérias de interesse científico e tecnológico nas áreas industrial, médica, agropecuária e ambiental. Atualmente, a Coleção dispõe de um acervo catalogado com aproximadamente 5.000 linhagens microbianas, com predominância de bactérias da ordem Actinomicetales.